口碑によれば、鴨川の川上の山王様(当社)と川下の氷川様(下大久保の氷川神社)は共に船でやって来た兄弟の神で、この地の開拓の祖神とされている。また嘉永四年(一八五一)「藤原細沼本系図」(下大久保・細沼幸一家文書)によれば、正応二年(一二八九)から「五九の市」と称して、五日・十五日・二十五日には鴨川の川上の山王社に市が立ち、九日・十九日・二十九日には川下の氷川社に市が立った。この二社は本地に十一面観音を祀るという。一方「大窪つじ村絵図」(大熊章一家文書)を見ると、当社の現鎮座地には「ひかわみょう志ん」と「びくにとう」があり、その南西の鴨川沿いに「三のう」と記されている。ちなみに「びくにとう」の地は現在当社の西側に当たり、そこからは奈良時代の布目瓦が出土し、古代寺院跡とされている。また「三のう」の地には明治初年まで兄神を葬ったと伝える塚があり、現在その跡には庚申社が祀られている。なお、この絵図には京六元年(一五二八)の年紀が見えるが、これには疑義がある。
化政期(一八〇四~一八)の『風土記稿』領家村の項には、絵図にあった氷川明神は既に見えず、「山王社 村の鎮守なり、村持、天王社」と記されている。明治初年に日枝神社と改称し、明治六年に村社となった